Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VgfQ0VGU4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
VgfQ0VGU4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VgfQ0VGU4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VgfQ0VGU4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
VgfQ0VGU4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VgfQ0VGU4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VgfQ0VGU4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VgfQ0VGU4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VgfQ0VGU4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.53■■■□□ 2
VgfQ0VGU4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VgfQ0VGU4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VgfQ0VGU4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VgfQ0VGU4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VgfQ0VGU4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VgfQ0VGU4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
VgfQ0VGU4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
VgfQ0VGU4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
VgfQ0VGU4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VgfQ0VGU4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VgfQ0VGU4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VgfQ0VGU4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VgfQ0VGU4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VgfQ0VGU4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VgfQ0VGU4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VgfQ0VGU4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VgfQ0VGU4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VgfQ0VGU4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VgfQ0VGU4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VgfQ0VGU4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VgfQ0VGU4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VgfQ0VGU4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VgfQ0VGU4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VgfQ0VGU4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VgfQ0VGU4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
VgfQ0VGU4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VgfQ0VGU4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
VgfQ0VGU4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
VgfQ0VGU4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
VgfQ0VGU4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VgfQ0VGU4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VgfQ0VGU4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VgfQ0VGU4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VgfQ0VGU4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VgfQ0VGU4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VgfQ0VGU4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VgfQ0VGU4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VgfQ0VGU4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VgfQ0VGU4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VgfQ0VGU4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VgfQ0VGU4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VgfQ0VGU4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VgfQ0VGU4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VgfQ0VGU4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VgfQ0VGU4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VgfQ0VGU4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VgfQ0VGU4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
VgfQ0VGU4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
VgfQ0VGU4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
VgfQ0VGU4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VgfQ0VGU4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VgfQ0VGU4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VgfQ0VGU4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VgfQ0VGU4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VgfQ0VGU4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VgfQ0VGU4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VgfQ0VGU4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VgfQ0VGU4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VgfQ0VGU4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VgfQ0VGU4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VgfQ0VGU4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VgfQ0VGU4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VgfQ0VGU4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VgfQ0VGU4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VgfQ0VGU4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VgfQ0VGU4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VgfQ0VGU4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VgfQ0VGU4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VgfQ0VGU4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VgfQ0VGU4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VgfQ0VGU4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VgfQ0VGU4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VgfQ0VGU4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VgfQ0VGU4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
VgfQ0VGU4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
VgfQ0VGU4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VgfQ0VGU4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VgfQ0VGU4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VgfQ0VGU4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VgfQ0VGU4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VgfQ0VGU4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VgfQ0VGU4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VgfQ0VGU4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VgfQ0VGU4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VgfQ0VGU4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VgfQ0VGU4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VgfQ0VGU4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VgfQ0VGU4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VgfQ0VGU4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VgfQ0VGU4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms