Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cass4Q08EC4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cass4Q08EC4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cass4Q08EC4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cass4Q08EC4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cass4Q08EC4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cass4Q08EC4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cass4Q08EC4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cass4Q08EC4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cass4Q08EC4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cass4Q08EC4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cass4Q08EC4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cass4Q08EC4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cass4Q08EC4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cass4Q08EC4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cass4Q08EC4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cass4Q08EC4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cass4Q08EC4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cass4Q08EC4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cass4Q08EC4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cass4Q08EC4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cass4Q08EC4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cass4Q08EC4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cass4Q08EC4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cass4Q08EC4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cass4Q08EC4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cass4Q08EC4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cass4Q08EC4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cass4Q08EC4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cass4Q08EC4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cass4Q08EC4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cass4Q08EC4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cass4Q08EC4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cass4Q08EC4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cass4Q08EC4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cass4Q08EC4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cass4Q08EC4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cass4Q08EC4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cass4Q08EC4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cass4Q08EC4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cass4Q08EC4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cass4Q08EC4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cass4Q08EC4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cass4Q08EC4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cass4Q08EC4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cass4Q08EC4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cass4Q08EC4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cass4Q08EC4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cass4Q08EC4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cass4Q08EC4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cass4Q08EC4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cass4Q08EC4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cass4Q08EC4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cass4Q08EC4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cass4Q08EC4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cass4Q08EC4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cass4Q08EC4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cass4Q08EC4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cass4Q08EC4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cass4Q08EC4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cass4Q08EC4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cass4Q08EC4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cass4Q08EC4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cass4Q08EC4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cass4Q08EC4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cass4Q08EC4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cass4Q08EC4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cass4Q08EC4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cass4Q08EC4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cass4Q08EC4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Cass4Q08EC4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cass4Q08EC4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cass4Q08EC4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cass4Q08EC4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cass4Q08EC4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cass4Q08EC4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cass4Q08EC4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cass4Q08EC4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cass4Q08EC4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cass4Q08EC4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cass4Q08EC4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cass4Q08EC4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cass4Q08EC4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cass4Q08EC4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cass4Q08EC4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cass4Q08EC4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cass4Q08EC4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cass4Q08EC4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cass4Q08EC4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cass4Q08EC4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cass4Q08EC4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cass4Q08EC4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cass4Q08EC4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cass4Q08EC4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cass4Q08EC4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cass4Q08EC4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cass4Q08EC4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Cass4Q08EC4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cass4Q08EC4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cass4Q08EC4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms