Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gata4Q08369 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gata4Q08369 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gata4Q08369 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gata4Q08369 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gata4Q08369 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gata4Q08369 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gata4Q08369 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gata4Q08369 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gata4Q08369 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gata4Q08369 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gata4Q08369 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gata4Q08369 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gata4Q08369 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gata4Q08369 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gata4Q08369 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gata4Q08369 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gata4Q08369 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gata4Q08369 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gata4Q08369 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gata4Q08369 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gata4Q08369 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gata4Q08369 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gata4Q08369 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gata4Q08369 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gata4Q08369 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gata4Q08369 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gata4Q08369 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gata4Q08369 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gata4Q08369 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gata4Q08369 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gata4Q08369 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gata4Q08369 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gata4Q08369 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gata4Q08369 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gata4Q08369 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gata4Q08369 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gata4Q08369 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gata4Q08369 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gata4Q08369 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gata4Q08369 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gata4Q08369 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gata4Q08369 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gata4Q08369 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gata4Q08369 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gata4Q08369 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gata4Q08369 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gata4Q08369 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gata4Q08369 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gata4Q08369 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gata4Q08369 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gata4Q08369 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gata4Q08369 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gata4Q08369 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gata4Q08369 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gata4Q08369 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gata4Q08369 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gata4Q08369 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gata4Q08369 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gata4Q08369 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gata4Q08369 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gata4Q08369 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gata4Q08369 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gata4Q08369 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gata4Q08369 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gata4Q08369 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gata4Q08369 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gata4Q08369 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gata4Q08369 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gata4Q08369 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gata4Q08369 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gata4Q08369 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gata4Q08369 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gata4Q08369 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gata4Q08369 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gata4Q08369 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gata4Q08369 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gata4Q08369 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gata4Q08369 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gata4Q08369 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gata4Q08369 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gata4Q08369 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gata4Q08369 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gata4Q08369 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gata4Q08369 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gata4Q08369 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gata4Q08369 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gata4Q08369 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gata4Q08369 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gata4Q08369 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gata4Q08369 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gata4Q08369 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gata4Q08369 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gata4Q08369 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gata4Q08369 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gata4Q08369 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gata4Q08369 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gata4Q08369 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gata4Q08369 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gata4Q08369 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms