Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cacna1cQ01815 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cacna1cQ01815 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cacna1cQ01815 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cacna1cQ01815 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cacna1cQ01815 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cacna1cQ01815 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cacna1cQ01815 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cacna1cQ01815 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cacna1cQ01815 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cacna1cQ01815 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cacna1cQ01815 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cacna1cQ01815 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cacna1cQ01815 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cacna1cQ01815 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cacna1cQ01815 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cacna1cQ01815 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cacna1cQ01815 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cacna1cQ01815 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cacna1cQ01815 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacna1cQ01815 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacna1cQ01815 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacna1cQ01815 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacna1cQ01815 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacna1cQ01815 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cacna1cQ01815 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cacna1cQ01815 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cacna1cQ01815 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cacna1cQ01815 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cacna1cQ01815 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna1cQ01815 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna1cQ01815 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna1cQ01815 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna1cQ01815 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna1cQ01815 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna1cQ01815 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna1cQ01815 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna1cQ01815 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna1cQ01815 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cacna1cQ01815 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna1cQ01815 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna1cQ01815 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna1cQ01815 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna1cQ01815 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna1cQ01815 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna1cQ01815 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cacna1cQ01815 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacna1cQ01815 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacna1cQ01815 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacna1cQ01815 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacna1cQ01815 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cacna1cQ01815 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna1cQ01815 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna1cQ01815 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna1cQ01815 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cacna1cQ01815 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna1cQ01815 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna1cQ01815 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna1cQ01815 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna1cQ01815 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cacna1cQ01815 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna1cQ01815 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna1cQ01815 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna1cQ01815 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna1cQ01815 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cacna1cQ01815 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna1cQ01815 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna1cQ01815 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna1cQ01815 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna1cQ01815 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cacna1cQ01815 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna1cQ01815 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna1cQ01815 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna1cQ01815 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna1cQ01815 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna1cQ01815 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cacna1cQ01815 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cacna1cQ01815 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna1cQ01815 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna1cQ01815 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna1cQ01815 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna1cQ01815 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna1cQ01815 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna1cQ01815 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna1cQ01815 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna1cQ01815 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna1cQ01815 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna1cQ01815 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna1cQ01815 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna1cQ01815 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna1cQ01815 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna1cQ01815 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna1cQ01815 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna1cQ01815 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna1cQ01815 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna1cQ01815 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna1cQ01815 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna1cQ01815 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna1cQ01815 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna1cQ01815 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms