Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ldb1P70662 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ldb1P70662 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ldb1P70662 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ldb1P70662 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ldb1P70662 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ldb1P70662 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ldb1P70662 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ldb1P70662 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ldb1P70662 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ldb1P70662 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ldb1P70662 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ldb1P70662 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ldb1P70662 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ldb1P70662 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ldb1P70662 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ldb1P70662 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ldb1P70662 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ldb1P70662 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ldb1P70662 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ldb1P70662 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ldb1P70662 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ldb1P70662 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ldb1P70662 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ldb1P70662 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ldb1P70662 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ldb1P70662 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ldb1P70662 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ldb1P70662 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ldb1P70662 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ldb1P70662 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ldb1P70662 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ldb1P70662 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ldb1P70662 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ldb1P70662 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ldb1P70662 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ldb1P70662 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ldb1P70662 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ldb1P70662 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ldb1P70662 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ldb1P70662 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ldb1P70662 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ldb1P70662 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ldb1P70662 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ldb1P70662 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ldb1P70662 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ldb1P70662 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ldb1P70662 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ldb1P70662 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ldb1P70662 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ldb1P70662 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ldb1P70662 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ldb1P70662 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ldb1P70662 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ldb1P70662 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ldb1P70662 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ldb1P70662 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ldb1P70662 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ldb1P70662 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ldb1P70662 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ldb1P70662 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ldb1P70662 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ldb1P70662 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ldb1P70662 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ldb1P70662 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ldb1P70662 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ldb1P70662 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ldb1P70662 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ldb1P70662 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ldb1P70662 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ldb1P70662 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ldb1P70662 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ldb1P70662 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ldb1P70662 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ldb1P70662 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ldb1P70662 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ldb1P70662 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ldb1P70662 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ldb1P70662 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ldb1P70662 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ldb1P70662 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ldb1P70662 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ldb1P70662 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ldb1P70662 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ldb1P70662 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ldb1P70662 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ldb1P70662 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ldb1P70662 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ldb1P70662 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ldb1P70662 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ldb1P70662 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ldb1P70662 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ldb1P70662 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ldb1P70662 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ldb1P70662 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ldb1P70662 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ldb1P70662 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ldb1P70662 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ldb1P70662 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ldb1P70662 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms