Protein–RNA interactions for Protein: P58801

Ripk2, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk2P58801 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ripk2P58801 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ripk2P58801 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ripk2P58801 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ripk2P58801 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ripk2P58801 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ripk2P58801 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ripk2P58801 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ripk2P58801 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ripk2P58801 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ripk2P58801 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ripk2P58801 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ripk2P58801 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ripk2P58801 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ripk2P58801 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ripk2P58801 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ripk2P58801 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ripk2P58801 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ripk2P58801 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ripk2P58801 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ripk2P58801 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ripk2P58801 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ripk2P58801 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ripk2P58801 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ripk2P58801 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ripk2P58801 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ripk2P58801 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ripk2P58801 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ripk2P58801 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ripk2P58801 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ripk2P58801 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ripk2P58801 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ripk2P58801 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ripk2P58801 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ripk2P58801 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ripk2P58801 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ripk2P58801 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ripk2P58801 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ripk2P58801 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ripk2P58801 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ripk2P58801 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ripk2P58801 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ripk2P58801 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ripk2P58801 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ripk2P58801 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ripk2P58801 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ripk2P58801 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ripk2P58801 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ripk2P58801 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ripk2P58801 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ripk2P58801 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ripk2P58801 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ripk2P58801 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ripk2P58801 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ripk2P58801 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ripk2P58801 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ripk2P58801 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ripk2P58801 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ripk2P58801 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ripk2P58801 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ripk2P58801 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ripk2P58801 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ripk2P58801 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ripk2P58801 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ripk2P58801 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ripk2P58801 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ripk2P58801 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ripk2P58801 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ripk2P58801 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ripk2P58801 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ripk2P58801 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ripk2P58801 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ripk2P58801 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ripk2P58801 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ripk2P58801 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ripk2P58801 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ripk2P58801 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ripk2P58801 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ripk2P58801 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ripk2P58801 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ripk2P58801 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ripk2P58801 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ripk2P58801 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ripk2P58801 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ripk2P58801 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ripk2P58801 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ripk2P58801 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ripk2P58801 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ripk2P58801 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ripk2P58801 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ripk2P58801 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ripk2P58801 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ripk2P58801 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ripk2P58801 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ripk2P58801 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ripk2P58801 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ripk2P58801 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ripk2P58801 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ripk2P58801 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ripk2P58801 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms