Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rad23aP54726 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rad23aP54726 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rad23aP54726 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rad23aP54726 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rad23aP54726 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rad23aP54726 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rad23aP54726 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rad23aP54726 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rad23aP54726 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rad23aP54726 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rad23aP54726 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Rad23aP54726 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rad23aP54726 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rad23aP54726 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rad23aP54726 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rad23aP54726 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rad23aP54726 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rad23aP54726 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rad23aP54726 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rad23aP54726 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Rad23aP54726 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rad23aP54726 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rad23aP54726 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rad23aP54726 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rad23aP54726 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rad23aP54726 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rad23aP54726 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rad23aP54726 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Rad23aP54726 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rad23aP54726 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rad23aP54726 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Rad23aP54726 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rad23aP54726 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rad23aP54726 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Rad23aP54726 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rad23aP54726 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rad23aP54726 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rad23aP54726 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rad23aP54726 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rad23aP54726 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rad23aP54726 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rad23aP54726 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rad23aP54726 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rad23aP54726 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rad23aP54726 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rad23aP54726 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rad23aP54726 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rad23aP54726 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rad23aP54726 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rad23aP54726 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rad23aP54726 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rad23aP54726 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rad23aP54726 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rad23aP54726 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rad23aP54726 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rad23aP54726 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rad23aP54726 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rad23aP54726 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rad23aP54726 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rad23aP54726 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rad23aP54726 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rad23aP54726 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rad23aP54726 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rad23aP54726 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rad23aP54726 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rad23aP54726 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rad23aP54726 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rad23aP54726 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rad23aP54726 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rad23aP54726 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rad23aP54726 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rad23aP54726 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rad23aP54726 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rad23aP54726 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rad23aP54726 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rad23aP54726 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rad23aP54726 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rad23aP54726 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rad23aP54726 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rad23aP54726 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rad23aP54726 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rad23aP54726 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rad23aP54726 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rad23aP54726 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rad23aP54726 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rad23aP54726 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Rad23aP54726 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rad23aP54726 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rad23aP54726 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rad23aP54726 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rad23aP54726 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rad23aP54726 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rad23aP54726 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rad23aP54726 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rad23aP54726 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rad23aP54726 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rad23aP54726 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rad23aP54726 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rad23aP54726 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms