Protein–RNA interactions for Protein: P53994

Rab2a, Ras-related protein Rab-2A, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab2aP53994 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab2aP53994 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab2aP53994 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab2aP53994 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab2aP53994 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab2aP53994 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab2aP53994 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab2aP53994 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab2aP53994 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab2aP53994 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab2aP53994 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab2aP53994 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab2aP53994 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab2aP53994 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab2aP53994 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab2aP53994 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab2aP53994 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab2aP53994 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab2aP53994 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab2aP53994 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab2aP53994 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab2aP53994 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab2aP53994 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab2aP53994 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab2aP53994 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab2aP53994 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab2aP53994 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab2aP53994 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab2aP53994 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab2aP53994 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab2aP53994 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab2aP53994 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab2aP53994 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab2aP53994 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab2aP53994 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab2aP53994 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab2aP53994 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab2aP53994 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab2aP53994 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab2aP53994 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab2aP53994 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab2aP53994 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab2aP53994 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab2aP53994 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab2aP53994 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab2aP53994 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab2aP53994 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab2aP53994 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab2aP53994 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab2aP53994 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab2aP53994 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab2aP53994 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab2aP53994 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab2aP53994 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab2aP53994 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab2aP53994 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab2aP53994 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab2aP53994 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab2aP53994 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab2aP53994 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab2aP53994 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab2aP53994 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab2aP53994 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab2aP53994 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab2aP53994 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab2aP53994 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab2aP53994 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab2aP53994 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab2aP53994 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab2aP53994 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab2aP53994 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab2aP53994 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab2aP53994 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab2aP53994 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab2aP53994 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab2aP53994 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab2aP53994 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab2aP53994 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab2aP53994 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab2aP53994 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab2aP53994 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab2aP53994 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab2aP53994 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab2aP53994 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab2aP53994 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab2aP53994 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab2aP53994 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab2aP53994 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab2aP53994 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab2aP53994 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab2aP53994 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab2aP53994 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab2aP53994 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab2aP53994 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab2aP53994 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab2aP53994 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab2aP53994 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab2aP53994 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab2aP53994 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab2aP53994 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms