Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl28P41105 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl28P41105 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl28P41105 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl28P41105 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpl28P41105 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpl28P41105 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpl28P41105 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpl28P41105 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpl28P41105 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpl28P41105 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpl28P41105 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpl28P41105 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpl28P41105 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl28P41105 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl28P41105 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl28P41105 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl28P41105 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl28P41105 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl28P41105 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl28P41105 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl28P41105 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl28P41105 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl28P41105 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl28P41105 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpl28P41105 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl28P41105 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl28P41105 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl28P41105 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl28P41105 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl28P41105 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl28P41105 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl28P41105 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl28P41105 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl28P41105 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl28P41105 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpl28P41105 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl28P41105 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl28P41105 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl28P41105 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl28P41105 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl28P41105 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl28P41105 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl28P41105 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rpl28P41105 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl28P41105 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl28P41105 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl28P41105 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl28P41105 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl28P41105 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl28P41105 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl28P41105 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl28P41105 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl28P41105 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl28P41105 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl28P41105 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl28P41105 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl28P41105 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl28P41105 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl28P41105 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl28P41105 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl28P41105 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl28P41105 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl28P41105 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl28P41105 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl28P41105 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl28P41105 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rpl28P41105 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl28P41105 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl28P41105 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl28P41105 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl28P41105 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl28P41105 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl28P41105 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl28P41105 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl28P41105 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl28P41105 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl28P41105 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl28P41105 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl28P41105 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl28P41105 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl28P41105 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl28P41105 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl28P41105 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl28P41105 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl28P41105 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl28P41105 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl28P41105 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl28P41105 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl28P41105 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl28P41105 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl28P41105 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl28P41105 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl28P41105 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl28P41105 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl28P41105 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl28P41105 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl28P41105 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl28P41105 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl28P41105 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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