Protein–RNA interactions for Protein: P35282

Rab21, Ras-related protein Rab-21, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab21P35282 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab21P35282 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab21P35282 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab21P35282 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab21P35282 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab21P35282 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab21P35282 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab21P35282 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab21P35282 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab21P35282 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab21P35282 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab21P35282 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab21P35282 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab21P35282 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rab21P35282 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab21P35282 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab21P35282 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab21P35282 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab21P35282 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab21P35282 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab21P35282 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab21P35282 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab21P35282 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab21P35282 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab21P35282 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab21P35282 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab21P35282 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab21P35282 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab21P35282 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab21P35282 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab21P35282 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab21P35282 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab21P35282 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab21P35282 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab21P35282 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab21P35282 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab21P35282 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab21P35282 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab21P35282 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab21P35282 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab21P35282 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab21P35282 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab21P35282 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rab21P35282 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rab21P35282 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rab21P35282 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rab21P35282 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rab21P35282 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab21P35282 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab21P35282 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab21P35282 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab21P35282 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab21P35282 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab21P35282 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab21P35282 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rab21P35282 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rab21P35282 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rab21P35282 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rab21P35282 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rab21P35282 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rab21P35282 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rab21P35282 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rab21P35282 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rab21P35282 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rab21P35282 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rab21P35282 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rab21P35282 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rab21P35282 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rab21P35282 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rab21P35282 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rab21P35282 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rab21P35282 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rab21P35282 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rab21P35282 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rab21P35282 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rab21P35282 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rab21P35282 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rab21P35282 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rab21P35282 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab21P35282 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab21P35282 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab21P35282 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab21P35282 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab21P35282 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab21P35282 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab21P35282 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab21P35282 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab21P35282 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab21P35282 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab21P35282 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rab21P35282 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab21P35282 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab21P35282 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab21P35282 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab21P35282 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab21P35282 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab21P35282 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab21P35282 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rab21P35282 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rab21P35282 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 199.9 ms