Protein–RNA interactions for Protein: P24549

Aldh1a1, Retinal dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a1P24549 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Aldh1a1P24549 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Aldh1a1P24549 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Aldh1a1P24549 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Aldh1a1P24549 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Aldh1a1P24549 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Aldh1a1P24549 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Aldh1a1P24549 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Aldh1a1P24549 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Aldh1a1P24549 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Aldh1a1P24549 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Aldh1a1P24549 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Aldh1a1P24549 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Aldh1a1P24549 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Aldh1a1P24549 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Aldh1a1P24549 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Aldh1a1P24549 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Aldh1a1P24549 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Aldh1a1P24549 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Aldh1a1P24549 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Aldh1a1P24549 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Aldh1a1P24549 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Aldh1a1P24549 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Aldh1a1P24549 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Aldh1a1P24549 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Aldh1a1P24549 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Aldh1a1P24549 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Aldh1a1P24549 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Aldh1a1P24549 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Aldh1a1P24549 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Aldh1a1P24549 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Aldh1a1P24549 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Aldh1a1P24549 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Aldh1a1P24549 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Aldh1a1P24549 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Aldh1a1P24549 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Aldh1a1P24549 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Aldh1a1P24549 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Aldh1a1P24549 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Aldh1a1P24549 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Aldh1a1P24549 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Aldh1a1P24549 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Aldh1a1P24549 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Aldh1a1P24549 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Aldh1a1P24549 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Aldh1a1P24549 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Aldh1a1P24549 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Aldh1a1P24549 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Aldh1a1P24549 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Aldh1a1P24549 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Aldh1a1P24549 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Aldh1a1P24549 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Aldh1a1P24549 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Aldh1a1P24549 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Aldh1a1P24549 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Aldh1a1P24549 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Aldh1a1P24549 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Aldh1a1P24549 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Aldh1a1P24549 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Aldh1a1P24549 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Aldh1a1P24549 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Aldh1a1P24549 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Aldh1a1P24549 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Aldh1a1P24549 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Aldh1a1P24549 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Aldh1a1P24549 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Aldh1a1P24549 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Aldh1a1P24549 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Aldh1a1P24549 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Aldh1a1P24549 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Aldh1a1P24549 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Aldh1a1P24549 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Aldh1a1P24549 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Aldh1a1P24549 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Aldh1a1P24549 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Aldh1a1P24549 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Aldh1a1P24549 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Aldh1a1P24549 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Aldh1a1P24549 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Aldh1a1P24549 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Aldh1a1P24549 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Aldh1a1P24549 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Aldh1a1P24549 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Aldh1a1P24549 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Aldh1a1P24549 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Aldh1a1P24549 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Aldh1a1P24549 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Aldh1a1P24549 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Aldh1a1P24549 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Aldh1a1P24549 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Aldh1a1P24549 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Aldh1a1P24549 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Aldh1a1P24549 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Aldh1a1P24549 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Aldh1a1P24549 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Aldh1a1P24549 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Aldh1a1P24549 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Aldh1a1P24549 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Aldh1a1P24549 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Aldh1a1P24549 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms