Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PdgfaP20033 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PdgfaP20033 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PdgfaP20033 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PdgfaP20033 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PdgfaP20033 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PdgfaP20033 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PdgfaP20033 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PdgfaP20033 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PdgfaP20033 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PdgfaP20033 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PdgfaP20033 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PdgfaP20033 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PdgfaP20033 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PdgfaP20033 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PdgfaP20033 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PdgfaP20033 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PdgfaP20033 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PdgfaP20033 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PdgfaP20033 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PdgfaP20033 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PdgfaP20033 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PdgfaP20033 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PdgfaP20033 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PdgfaP20033 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PdgfaP20033 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PdgfaP20033 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PdgfaP20033 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PdgfaP20033 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PdgfaP20033 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PdgfaP20033 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PdgfaP20033 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PdgfaP20033 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PdgfaP20033 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PdgfaP20033 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PdgfaP20033 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PdgfaP20033 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PdgfaP20033 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PdgfaP20033 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PdgfaP20033 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PdgfaP20033 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PdgfaP20033 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PdgfaP20033 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PdgfaP20033 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PdgfaP20033 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PdgfaP20033 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PdgfaP20033 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PdgfaP20033 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PdgfaP20033 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PdgfaP20033 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PdgfaP20033 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PdgfaP20033 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PdgfaP20033 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PdgfaP20033 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PdgfaP20033 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PdgfaP20033 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PdgfaP20033 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PdgfaP20033 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PdgfaP20033 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PdgfaP20033 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PdgfaP20033 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PdgfaP20033 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PdgfaP20033 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PdgfaP20033 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PdgfaP20033 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PdgfaP20033 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PdgfaP20033 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PdgfaP20033 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PdgfaP20033 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PdgfaP20033 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PdgfaP20033 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PdgfaP20033 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PdgfaP20033 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PdgfaP20033 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PdgfaP20033 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PdgfaP20033 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PdgfaP20033 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PdgfaP20033 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PdgfaP20033 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PdgfaP20033 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PdgfaP20033 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PdgfaP20033 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PdgfaP20033 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PdgfaP20033 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PdgfaP20033 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PdgfaP20033 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PdgfaP20033 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PdgfaP20033 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PdgfaP20033 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PdgfaP20033 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PdgfaP20033 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PdgfaP20033 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PdgfaP20033 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PdgfaP20033 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PdgfaP20033 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PdgfaP20033 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PdgfaP20033 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PdgfaP20033 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PdgfaP20033 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PdgfaP20033 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms