Protein–RNA interactions for Protein: P01736

T-cell receptor beta chain V region PHDS203 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01736 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01736 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01736 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01736 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01736 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01736 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01736 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01736 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P01736 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01736 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01736 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01736 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01736 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01736 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01736 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01736 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01736 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01736 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01736 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P01736 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01736 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01736 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01736 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01736 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01736 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01736 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01736 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
P01736 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
P01736 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01736 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01736 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01736 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01736 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01736 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01736 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01736 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01736 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01736 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01736 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01736 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
P01736 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01736 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01736 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01736 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01736 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01736 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01736 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01736 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01736 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01736 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01736 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01736 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01736 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01736 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01736 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01736 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01736 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01736 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01736 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01736 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01736 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01736 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01736 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01736 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01736 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01736 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01736 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01736 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01736 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01736 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01736 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01736 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01736 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
P01736 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01736 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01736 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01736 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01736 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01736 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
P01736 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01736 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01736 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01736 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
P01736 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01736 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01736 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01736 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01736 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01736 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01736 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01736 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01736 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01736 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01736 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01736 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
P01736 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01736 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01736 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01736 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01736 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms