Protein–RNA interactions for Protein: O70493

Snx12, Sorting nexin-12, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx12O70493 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx12O70493 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx12O70493 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx12O70493 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx12O70493 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx12O70493 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx12O70493 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx12O70493 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx12O70493 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx12O70493 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx12O70493 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx12O70493 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx12O70493 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx12O70493 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx12O70493 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx12O70493 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx12O70493 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Snx12O70493 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Snx12O70493 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Snx12O70493 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Snx12O70493 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snx12O70493 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snx12O70493 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snx12O70493 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx12O70493 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx12O70493 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx12O70493 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx12O70493 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx12O70493 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx12O70493 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx12O70493 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx12O70493 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx12O70493 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx12O70493 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx12O70493 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx12O70493 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx12O70493 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx12O70493 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx12O70493 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx12O70493 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx12O70493 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx12O70493 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx12O70493 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx12O70493 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx12O70493 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx12O70493 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx12O70493 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx12O70493 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx12O70493 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx12O70493 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx12O70493 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx12O70493 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx12O70493 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx12O70493 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snx12O70493 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Snx12O70493 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Snx12O70493 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Snx12O70493 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Snx12O70493 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx12O70493 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx12O70493 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx12O70493 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx12O70493 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx12O70493 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx12O70493 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx12O70493 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx12O70493 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx12O70493 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx12O70493 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx12O70493 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx12O70493 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx12O70493 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx12O70493 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx12O70493 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx12O70493 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx12O70493 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx12O70493 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx12O70493 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx12O70493 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx12O70493 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx12O70493 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx12O70493 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx12O70493 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx12O70493 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx12O70493 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx12O70493 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx12O70493 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx12O70493 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx12O70493 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx12O70493 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx12O70493 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx12O70493 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx12O70493 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx12O70493 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx12O70493 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx12O70493 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx12O70493 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx12O70493 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx12O70493 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx12O70493 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms