Protein–RNA interactions for Protein: O35633

Slc32a1, Vesicular inhibitory amino acid transporter, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc32a1O35633 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc32a1O35633 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc32a1O35633 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc32a1O35633 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc32a1O35633 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc32a1O35633 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc32a1O35633 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc32a1O35633 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc32a1O35633 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc32a1O35633 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc32a1O35633 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc32a1O35633 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc32a1O35633 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc32a1O35633 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc32a1O35633 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc32a1O35633 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc32a1O35633 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc32a1O35633 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc32a1O35633 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc32a1O35633 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc32a1O35633 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc32a1O35633 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc32a1O35633 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc32a1O35633 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc32a1O35633 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc32a1O35633 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc32a1O35633 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc32a1O35633 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc32a1O35633 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc32a1O35633 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc32a1O35633 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc32a1O35633 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc32a1O35633 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc32a1O35633 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc32a1O35633 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc32a1O35633 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc32a1O35633 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc32a1O35633 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc32a1O35633 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc32a1O35633 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc32a1O35633 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc32a1O35633 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc32a1O35633 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc32a1O35633 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc32a1O35633 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc32a1O35633 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc32a1O35633 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc32a1O35633 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc32a1O35633 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc32a1O35633 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc32a1O35633 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc32a1O35633 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc32a1O35633 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc32a1O35633 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc32a1O35633 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc32a1O35633 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc32a1O35633 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc32a1O35633 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc32a1O35633 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc32a1O35633 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc32a1O35633 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc32a1O35633 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc32a1O35633 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc32a1O35633 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc32a1O35633 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc32a1O35633 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc32a1O35633 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc32a1O35633 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc32a1O35633 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc32a1O35633 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc32a1O35633 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc32a1O35633 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc32a1O35633 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc32a1O35633 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc32a1O35633 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc32a1O35633 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc32a1O35633 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc32a1O35633 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc32a1O35633 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc32a1O35633 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc32a1O35633 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc32a1O35633 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc32a1O35633 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc32a1O35633 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc32a1O35633 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc32a1O35633 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc32a1O35633 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc32a1O35633 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc32a1O35633 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc32a1O35633 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc32a1O35633 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc32a1O35633 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc32a1O35633 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Slc32a1O35633 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc32a1O35633 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc32a1O35633 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc32a1O35633 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc32a1O35633 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc32a1O35633 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc32a1O35633 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms