Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MsmbO08540 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MsmbO08540 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MsmbO08540 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MsmbO08540 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MsmbO08540 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MsmbO08540 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MsmbO08540 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MsmbO08540 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MsmbO08540 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MsmbO08540 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MsmbO08540 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MsmbO08540 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MsmbO08540 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MsmbO08540 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MsmbO08540 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MsmbO08540 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MsmbO08540 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MsmbO08540 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MsmbO08540 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MsmbO08540 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MsmbO08540 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MsmbO08540 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MsmbO08540 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MsmbO08540 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MsmbO08540 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MsmbO08540 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MsmbO08540 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MsmbO08540 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MsmbO08540 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MsmbO08540 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MsmbO08540 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MsmbO08540 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MsmbO08540 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MsmbO08540 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MsmbO08540 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MsmbO08540 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MsmbO08540 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MsmbO08540 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MsmbO08540 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MsmbO08540 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MsmbO08540 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MsmbO08540 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MsmbO08540 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MsmbO08540 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
MsmbO08540 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MsmbO08540 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MsmbO08540 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MsmbO08540 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MsmbO08540 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MsmbO08540 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MsmbO08540 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MsmbO08540 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
MsmbO08540 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MsmbO08540 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MsmbO08540 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MsmbO08540 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MsmbO08540 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MsmbO08540 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
MsmbO08540 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
MsmbO08540 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MsmbO08540 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MsmbO08540 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MsmbO08540 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MsmbO08540 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MsmbO08540 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MsmbO08540 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MsmbO08540 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MsmbO08540 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MsmbO08540 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MsmbO08540 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MsmbO08540 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
MsmbO08540 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MsmbO08540 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MsmbO08540 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MsmbO08540 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MsmbO08540 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MsmbO08540 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MsmbO08540 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MsmbO08540 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MsmbO08540 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MsmbO08540 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MsmbO08540 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MsmbO08540 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MsmbO08540 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MsmbO08540 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MsmbO08540 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MsmbO08540 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MsmbO08540 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MsmbO08540 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MsmbO08540 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MsmbO08540 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MsmbO08540 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MsmbO08540 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MsmbO08540 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MsmbO08540 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MsmbO08540 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MsmbO08540 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MsmbO08540 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MsmbO08540 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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