Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm21818J3KMS6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm21818J3KMS6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm21818J3KMS6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm21818J3KMS6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm21818J3KMS6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm21818J3KMS6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm21818J3KMS6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm21818J3KMS6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm21818J3KMS6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm21818J3KMS6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm21818J3KMS6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm21818J3KMS6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm21818J3KMS6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm21818J3KMS6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm21818J3KMS6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm21818J3KMS6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm21818J3KMS6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm21818J3KMS6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm21818J3KMS6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm21818J3KMS6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm21818J3KMS6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm21818J3KMS6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm21818J3KMS6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm21818J3KMS6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm21818J3KMS6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm21818J3KMS6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm21818J3KMS6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm21818J3KMS6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm21818J3KMS6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm21818J3KMS6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm21818J3KMS6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm21818J3KMS6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm21818J3KMS6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm21818J3KMS6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm21818J3KMS6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm21818J3KMS6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm21818J3KMS6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm21818J3KMS6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm21818J3KMS6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm21818J3KMS6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm21818J3KMS6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm21818J3KMS6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm21818J3KMS6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm21818J3KMS6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm21818J3KMS6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm21818J3KMS6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm21818J3KMS6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm21818J3KMS6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm21818J3KMS6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm21818J3KMS6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm21818J3KMS6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm21818J3KMS6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm21818J3KMS6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm21818J3KMS6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm21818J3KMS6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm21818J3KMS6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm21818J3KMS6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm21818J3KMS6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm21818J3KMS6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm21818J3KMS6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm21818J3KMS6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm21818J3KMS6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm21818J3KMS6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm21818J3KMS6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm21818J3KMS6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm21818J3KMS6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm21818J3KMS6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm21818J3KMS6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm21818J3KMS6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Gm21818J3KMS6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm21818J3KMS6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm21818J3KMS6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm21818J3KMS6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm21818J3KMS6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm21818J3KMS6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm21818J3KMS6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm21818J3KMS6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm21818J3KMS6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm21818J3KMS6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm21818J3KMS6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm21818J3KMS6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm21818J3KMS6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm21818J3KMS6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm21818J3KMS6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm21818J3KMS6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm21818J3KMS6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm21818J3KMS6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm21818J3KMS6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm21818J3KMS6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm21818J3KMS6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm21818J3KMS6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm21818J3KMS6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm21818J3KMS6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm21818J3KMS6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm21818J3KMS6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm21818J3KMS6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm21818J3KMS6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm21818J3KMS6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm21818J3KMS6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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