Protein–RNA interactions for Protein: F6XX07

Gm21970, Predicted gene 21970 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21970F6XX07 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm21970F6XX07 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm21970F6XX07 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm21970F6XX07 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm21970F6XX07 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm21970F6XX07 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm21970F6XX07 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm21970F6XX07 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm21970F6XX07 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm21970F6XX07 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm21970F6XX07 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm21970F6XX07 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm21970F6XX07 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm21970F6XX07 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm21970F6XX07 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm21970F6XX07 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm21970F6XX07 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm21970F6XX07 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm21970F6XX07 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm21970F6XX07 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm21970F6XX07 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm21970F6XX07 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm21970F6XX07 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm21970F6XX07 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm21970F6XX07 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm21970F6XX07 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm21970F6XX07 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm21970F6XX07 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm21970F6XX07 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm21970F6XX07 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm21970F6XX07 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm21970F6XX07 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm21970F6XX07 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm21970F6XX07 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm21970F6XX07 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm21970F6XX07 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm21970F6XX07 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm21970F6XX07 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm21970F6XX07 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm21970F6XX07 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm21970F6XX07 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm21970F6XX07 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm21970F6XX07 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm21970F6XX07 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm21970F6XX07 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm21970F6XX07 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm21970F6XX07 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21970F6XX07 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21970F6XX07 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21970F6XX07 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21970F6XX07 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21970F6XX07 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21970F6XX07 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21970F6XX07 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21970F6XX07 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21970F6XX07 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21970F6XX07 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21970F6XX07 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21970F6XX07 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21970F6XX07 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm21970F6XX07 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21970F6XX07 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21970F6XX07 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm21970F6XX07 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21970F6XX07 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21970F6XX07 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21970F6XX07 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21970F6XX07 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21970F6XX07 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21970F6XX07 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21970F6XX07 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21970F6XX07 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21970F6XX07 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21970F6XX07 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21970F6XX07 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21970F6XX07 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21970F6XX07 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21970F6XX07 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21970F6XX07 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21970F6XX07 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21970F6XX07 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21970F6XX07 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21970F6XX07 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21970F6XX07 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21970F6XX07 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21970F6XX07 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21970F6XX07 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21970F6XX07 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21970F6XX07 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21970F6XX07 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21970F6XX07 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21970F6XX07 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21970F6XX07 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21970F6XX07 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21970F6XX07 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21970F6XX07 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21970F6XX07 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21970F6XX07 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21970F6XX07 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21970F6XX07 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms