Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm28305F6U473 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28305F6U473 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28305F6U473 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28305F6U473 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28305F6U473 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28305F6U473 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28305F6U473 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm28305F6U473 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28305F6U473 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28305F6U473 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28305F6U473 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28305F6U473 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28305F6U473 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28305F6U473 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28305F6U473 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28305F6U473 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28305F6U473 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28305F6U473 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm28305F6U473 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28305F6U473 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28305F6U473 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28305F6U473 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm28305F6U473 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm28305F6U473 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm28305F6U473 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28305F6U473 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28305F6U473 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28305F6U473 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28305F6U473 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28305F6U473 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm28305F6U473 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28305F6U473 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28305F6U473 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28305F6U473 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28305F6U473 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28305F6U473 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm28305F6U473 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm28305F6U473 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm28305F6U473 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm28305F6U473 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm28305F6U473 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm28305F6U473 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm28305F6U473 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm28305F6U473 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm28305F6U473 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm28305F6U473 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm28305F6U473 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm28305F6U473 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm28305F6U473 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm28305F6U473 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm28305F6U473 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm28305F6U473 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm28305F6U473 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm28305F6U473 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm28305F6U473 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm28305F6U473 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm28305F6U473 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm28305F6U473 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm28305F6U473 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm28305F6U473 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm28305F6U473 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm28305F6U473 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm28305F6U473 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm28305F6U473 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm28305F6U473 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm28305F6U473 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm28305F6U473 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm28305F6U473 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm28305F6U473 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm28305F6U473 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm28305F6U473 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm28305F6U473 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28305F6U473 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28305F6U473 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28305F6U473 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28305F6U473 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28305F6U473 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28305F6U473 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28305F6U473 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28305F6U473 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28305F6U473 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28305F6U473 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm28305F6U473 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm28305F6U473 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm28305F6U473 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm28305F6U473 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm28305F6U473 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm28305F6U473 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm28305F6U473 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm28305F6U473 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm28305F6U473 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm28305F6U473 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm28305F6U473 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm28305F6U473 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm28305F6U473 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm28305F6U473 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28305F6U473 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28305F6U473 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28305F6U473 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms