Protein–RNA interactions for Protein: F6SKY8

Gm3072, Predicted gene 3072 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3072F6SKY8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm3072F6SKY8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm3072F6SKY8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm3072F6SKY8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm3072F6SKY8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm3072F6SKY8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm3072F6SKY8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm3072F6SKY8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm3072F6SKY8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm3072F6SKY8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm3072F6SKY8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm3072F6SKY8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm3072F6SKY8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm3072F6SKY8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm3072F6SKY8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm3072F6SKY8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm3072F6SKY8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm3072F6SKY8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm3072F6SKY8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3072F6SKY8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3072F6SKY8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3072F6SKY8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3072F6SKY8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3072F6SKY8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3072F6SKY8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3072F6SKY8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3072F6SKY8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3072F6SKY8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm3072F6SKY8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm3072F6SKY8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm3072F6SKY8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm3072F6SKY8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3072F6SKY8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3072F6SKY8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3072F6SKY8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3072F6SKY8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3072F6SKY8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3072F6SKY8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3072F6SKY8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3072F6SKY8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3072F6SKY8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3072F6SKY8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3072F6SKY8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3072F6SKY8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3072F6SKY8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3072F6SKY8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3072F6SKY8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3072F6SKY8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3072F6SKY8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3072F6SKY8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3072F6SKY8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3072F6SKY8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3072F6SKY8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3072F6SKY8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3072F6SKY8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3072F6SKY8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3072F6SKY8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3072F6SKY8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3072F6SKY8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3072F6SKY8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3072F6SKY8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3072F6SKY8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3072F6SKY8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3072F6SKY8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3072F6SKY8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3072F6SKY8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3072F6SKY8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3072F6SKY8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3072F6SKY8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3072F6SKY8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3072F6SKY8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3072F6SKY8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3072F6SKY8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3072F6SKY8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3072F6SKY8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3072F6SKY8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3072F6SKY8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3072F6SKY8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3072F6SKY8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3072F6SKY8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3072F6SKY8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3072F6SKY8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3072F6SKY8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3072F6SKY8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3072F6SKY8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3072F6SKY8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3072F6SKY8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3072F6SKY8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3072F6SKY8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3072F6SKY8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3072F6SKY8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3072F6SKY8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3072F6SKY8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3072F6SKY8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3072F6SKY8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3072F6SKY8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3072F6SKY8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3072F6SKY8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3072F6SKY8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3072F6SKY8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms