Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lmod3E9QA62 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lmod3E9QA62 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lmod3E9QA62 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lmod3E9QA62 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lmod3E9QA62 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lmod3E9QA62 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lmod3E9QA62 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lmod3E9QA62 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lmod3E9QA62 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lmod3E9QA62 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lmod3E9QA62 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lmod3E9QA62 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lmod3E9QA62 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lmod3E9QA62 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lmod3E9QA62 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lmod3E9QA62 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lmod3E9QA62 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lmod3E9QA62 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lmod3E9QA62 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lmod3E9QA62 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lmod3E9QA62 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lmod3E9QA62 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lmod3E9QA62 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lmod3E9QA62 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lmod3E9QA62 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lmod3E9QA62 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lmod3E9QA62 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lmod3E9QA62 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lmod3E9QA62 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lmod3E9QA62 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmod3E9QA62 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmod3E9QA62 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmod3E9QA62 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmod3E9QA62 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmod3E9QA62 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmod3E9QA62 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmod3E9QA62 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lmod3E9QA62 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lmod3E9QA62 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lmod3E9QA62 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lmod3E9QA62 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lmod3E9QA62 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lmod3E9QA62 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lmod3E9QA62 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lmod3E9QA62 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmod3E9QA62 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmod3E9QA62 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmod3E9QA62 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmod3E9QA62 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmod3E9QA62 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmod3E9QA62 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmod3E9QA62 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmod3E9QA62 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmod3E9QA62 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmod3E9QA62 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmod3E9QA62 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmod3E9QA62 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lmod3E9QA62 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lmod3E9QA62 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lmod3E9QA62 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lmod3E9QA62 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lmod3E9QA62 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lmod3E9QA62 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lmod3E9QA62 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lmod3E9QA62 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lmod3E9QA62 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Lmod3E9QA62 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Lmod3E9QA62 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lmod3E9QA62 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lmod3E9QA62 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lmod3E9QA62 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lmod3E9QA62 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lmod3E9QA62 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lmod3E9QA62 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lmod3E9QA62 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lmod3E9QA62 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lmod3E9QA62 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lmod3E9QA62 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lmod3E9QA62 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lmod3E9QA62 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lmod3E9QA62 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lmod3E9QA62 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lmod3E9QA62 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lmod3E9QA62 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Lmod3E9QA62 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lmod3E9QA62 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lmod3E9QA62 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lmod3E9QA62 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lmod3E9QA62 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lmod3E9QA62 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lmod3E9QA62 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lmod3E9QA62 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lmod3E9QA62 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lmod3E9QA62 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lmod3E9QA62 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lmod3E9QA62 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lmod3E9QA62 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Lmod3E9QA62 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Lmod3E9QA62 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms