Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R7

Utrn, Utrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UtrnE9Q6R7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UtrnE9Q6R7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UtrnE9Q6R7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UtrnE9Q6R7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
UtrnE9Q6R7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
UtrnE9Q6R7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
UtrnE9Q6R7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UtrnE9Q6R7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UtrnE9Q6R7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
UtrnE9Q6R7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
UtrnE9Q6R7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
UtrnE9Q6R7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UtrnE9Q6R7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UtrnE9Q6R7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UtrnE9Q6R7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UtrnE9Q6R7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UtrnE9Q6R7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
UtrnE9Q6R7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
UtrnE9Q6R7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
UtrnE9Q6R7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
UtrnE9Q6R7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
UtrnE9Q6R7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
UtrnE9Q6R7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UtrnE9Q6R7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UtrnE9Q6R7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UtrnE9Q6R7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UtrnE9Q6R7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UtrnE9Q6R7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
UtrnE9Q6R7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UtrnE9Q6R7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UtrnE9Q6R7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UtrnE9Q6R7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UtrnE9Q6R7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
UtrnE9Q6R7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UtrnE9Q6R7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
UtrnE9Q6R7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UtrnE9Q6R7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
UtrnE9Q6R7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UtrnE9Q6R7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UtrnE9Q6R7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UtrnE9Q6R7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UtrnE9Q6R7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UtrnE9Q6R7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UtrnE9Q6R7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UtrnE9Q6R7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
UtrnE9Q6R7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
UtrnE9Q6R7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UtrnE9Q6R7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UtrnE9Q6R7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
UtrnE9Q6R7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UtrnE9Q6R7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
UtrnE9Q6R7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
UtrnE9Q6R7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
UtrnE9Q6R7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UtrnE9Q6R7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UtrnE9Q6R7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UtrnE9Q6R7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
UtrnE9Q6R7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
UtrnE9Q6R7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
UtrnE9Q6R7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UtrnE9Q6R7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
UtrnE9Q6R7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UtrnE9Q6R7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UtrnE9Q6R7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UtrnE9Q6R7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
UtrnE9Q6R7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
UtrnE9Q6R7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UtrnE9Q6R7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UtrnE9Q6R7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UtrnE9Q6R7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UtrnE9Q6R7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
UtrnE9Q6R7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
UtrnE9Q6R7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UtrnE9Q6R7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
UtrnE9Q6R7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UtrnE9Q6R7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
UtrnE9Q6R7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UtrnE9Q6R7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
UtrnE9Q6R7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UtrnE9Q6R7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
UtrnE9Q6R7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
UtrnE9Q6R7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UtrnE9Q6R7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UtrnE9Q6R7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UtrnE9Q6R7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UtrnE9Q6R7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UtrnE9Q6R7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UtrnE9Q6R7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UtrnE9Q6R7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UtrnE9Q6R7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UtrnE9Q6R7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UtrnE9Q6R7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UtrnE9Q6R7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
UtrnE9Q6R7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
UtrnE9Q6R7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UtrnE9Q6R7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UtrnE9Q6R7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UtrnE9Q6R7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UtrnE9Q6R7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UtrnE9Q6R7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms