Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R1

Itga10, Integrin, alpha 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga10E9Q6R1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itga10E9Q6R1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Itga10E9Q6R1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itga10E9Q6R1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itga10E9Q6R1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itga10E9Q6R1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itga10E9Q6R1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itga10E9Q6R1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itga10E9Q6R1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Itga10E9Q6R1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itga10E9Q6R1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itga10E9Q6R1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Itga10E9Q6R1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itga10E9Q6R1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itga10E9Q6R1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itga10E9Q6R1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itga10E9Q6R1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itga10E9Q6R1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Itga10E9Q6R1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itga10E9Q6R1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itga10E9Q6R1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itga10E9Q6R1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itga10E9Q6R1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itga10E9Q6R1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itga10E9Q6R1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itga10E9Q6R1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itga10E9Q6R1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Itga10E9Q6R1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itga10E9Q6R1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itga10E9Q6R1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itga10E9Q6R1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itga10E9Q6R1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga10E9Q6R1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga10E9Q6R1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga10E9Q6R1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga10E9Q6R1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga10E9Q6R1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga10E9Q6R1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga10E9Q6R1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga10E9Q6R1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga10E9Q6R1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga10E9Q6R1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga10E9Q6R1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga10E9Q6R1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga10E9Q6R1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga10E9Q6R1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga10E9Q6R1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga10E9Q6R1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga10E9Q6R1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga10E9Q6R1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga10E9Q6R1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga10E9Q6R1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga10E9Q6R1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga10E9Q6R1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga10E9Q6R1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga10E9Q6R1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga10E9Q6R1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga10E9Q6R1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga10E9Q6R1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Itga10E9Q6R1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Itga10E9Q6R1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Itga10E9Q6R1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Itga10E9Q6R1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Itga10E9Q6R1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Itga10E9Q6R1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Itga10E9Q6R1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itga10E9Q6R1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itga10E9Q6R1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itga10E9Q6R1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga10E9Q6R1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga10E9Q6R1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga10E9Q6R1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga10E9Q6R1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga10E9Q6R1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga10E9Q6R1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga10E9Q6R1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga10E9Q6R1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga10E9Q6R1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga10E9Q6R1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itga10E9Q6R1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga10E9Q6R1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga10E9Q6R1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga10E9Q6R1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga10E9Q6R1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga10E9Q6R1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga10E9Q6R1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga10E9Q6R1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Itga10E9Q6R1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga10E9Q6R1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga10E9Q6R1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga10E9Q6R1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga10E9Q6R1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga10E9Q6R1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga10E9Q6R1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga10E9Q6R1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Itga10E9Q6R1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itga10E9Q6R1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itga10E9Q6R1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itga10E9Q6R1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Itga10E9Q6R1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms