Protein–RNA interactions for Protein: E9Q612

Ptpro, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, mousemouse

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtproE9Q612 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PtproE9Q612 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtproE9Q612 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtproE9Q612 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtproE9Q612 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtproE9Q612 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtproE9Q612 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtproE9Q612 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtproE9Q612 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtproE9Q612 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtproE9Q612 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PtproE9Q612 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PtproE9Q612 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PtproE9Q612 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PtproE9Q612 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PtproE9Q612 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PtproE9Q612 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtproE9Q612 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtproE9Q612 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtproE9Q612 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtproE9Q612 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtproE9Q612 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtproE9Q612 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtproE9Q612 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtproE9Q612 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtproE9Q612 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtproE9Q612 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtproE9Q612 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtproE9Q612 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtproE9Q612 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtproE9Q612 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtproE9Q612 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtproE9Q612 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtproE9Q612 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtproE9Q612 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtproE9Q612 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtproE9Q612 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtproE9Q612 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtproE9Q612 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PtproE9Q612 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PtproE9Q612 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PtproE9Q612 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PtproE9Q612 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PtproE9Q612 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PtproE9Q612 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PtproE9Q612 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtproE9Q612 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtproE9Q612 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtproE9Q612 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtproE9Q612 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtproE9Q612 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtproE9Q612 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtproE9Q612 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtproE9Q612 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtproE9Q612 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtproE9Q612 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtproE9Q612 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtproE9Q612 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtproE9Q612 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtproE9Q612 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtproE9Q612 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtproE9Q612 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtproE9Q612 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtproE9Q612 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtproE9Q612 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtproE9Q612 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtproE9Q612 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtproE9Q612 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtproE9Q612 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtproE9Q612 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtproE9Q612 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtproE9Q612 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtproE9Q612 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtproE9Q612 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PtproE9Q612 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
PtproE9Q612 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtproE9Q612 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtproE9Q612 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtproE9Q612 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtproE9Q612 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtproE9Q612 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtproE9Q612 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtproE9Q612 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtproE9Q612 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtproE9Q612 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtproE9Q612 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtproE9Q612 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PtproE9Q612 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtproE9Q612 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtproE9Q612 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtproE9Q612 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtproE9Q612 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtproE9Q612 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtproE9Q612 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtproE9Q612 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtproE9Q612 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtproE9Q612 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtproE9Q612 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtproE9Q612 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtproE9Q612 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms