Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sfta2E9PXB6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sfta2E9PXB6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sfta2E9PXB6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sfta2E9PXB6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sfta2E9PXB6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sfta2E9PXB6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sfta2E9PXB6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sfta2E9PXB6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sfta2E9PXB6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sfta2E9PXB6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sfta2E9PXB6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sfta2E9PXB6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sfta2E9PXB6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sfta2E9PXB6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sfta2E9PXB6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sfta2E9PXB6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sfta2E9PXB6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sfta2E9PXB6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sfta2E9PXB6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sfta2E9PXB6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sfta2E9PXB6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Sfta2E9PXB6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sfta2E9PXB6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sfta2E9PXB6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sfta2E9PXB6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sfta2E9PXB6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sfta2E9PXB6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sfta2E9PXB6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sfta2E9PXB6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sfta2E9PXB6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sfta2E9PXB6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sfta2E9PXB6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sfta2E9PXB6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sfta2E9PXB6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sfta2E9PXB6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sfta2E9PXB6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sfta2E9PXB6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sfta2E9PXB6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sfta2E9PXB6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sfta2E9PXB6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sfta2E9PXB6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sfta2E9PXB6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sfta2E9PXB6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sfta2E9PXB6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sfta2E9PXB6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sfta2E9PXB6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sfta2E9PXB6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sfta2E9PXB6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sfta2E9PXB6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Sfta2E9PXB6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sfta2E9PXB6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sfta2E9PXB6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sfta2E9PXB6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sfta2E9PXB6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sfta2E9PXB6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sfta2E9PXB6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sfta2E9PXB6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sfta2E9PXB6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sfta2E9PXB6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sfta2E9PXB6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sfta2E9PXB6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sfta2E9PXB6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sfta2E9PXB6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sfta2E9PXB6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sfta2E9PXB6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sfta2E9PXB6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sfta2E9PXB6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sfta2E9PXB6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sfta2E9PXB6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sfta2E9PXB6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sfta2E9PXB6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sfta2E9PXB6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sfta2E9PXB6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sfta2E9PXB6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sfta2E9PXB6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sfta2E9PXB6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sfta2E9PXB6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sfta2E9PXB6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sfta2E9PXB6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sfta2E9PXB6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sfta2E9PXB6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sfta2E9PXB6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sfta2E9PXB6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sfta2E9PXB6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sfta2E9PXB6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sfta2E9PXB6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sfta2E9PXB6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sfta2E9PXB6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sfta2E9PXB6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sfta2E9PXB6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sfta2E9PXB6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sfta2E9PXB6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sfta2E9PXB6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sfta2E9PXB6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Sfta2E9PXB6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sfta2E9PXB6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sfta2E9PXB6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sfta2E9PXB6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sfta2E9PXB6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms