Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AU015836B2RUM3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
AU015836B2RUM3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AU015836B2RUM3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AU015836B2RUM3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AU015836B2RUM3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AU015836B2RUM3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AU015836B2RUM3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AU015836B2RUM3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AU015836B2RUM3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AU015836B2RUM3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AU015836B2RUM3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AU015836B2RUM3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AU015836B2RUM3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AU015836B2RUM3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AU015836B2RUM3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
AU015836B2RUM3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
AU015836B2RUM3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AU015836B2RUM3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AU015836B2RUM3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AU015836B2RUM3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AU015836B2RUM3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AU015836B2RUM3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AU015836B2RUM3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AU015836B2RUM3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AU015836B2RUM3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AU015836B2RUM3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AU015836B2RUM3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AU015836B2RUM3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AU015836B2RUM3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AU015836B2RUM3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AU015836B2RUM3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AU015836B2RUM3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AU015836B2RUM3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
AU015836B2RUM3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
AU015836B2RUM3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
AU015836B2RUM3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
AU015836B2RUM3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
AU015836B2RUM3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AU015836B2RUM3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AU015836B2RUM3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AU015836B2RUM3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AU015836B2RUM3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AU015836B2RUM3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AU015836B2RUM3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AU015836B2RUM3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AU015836B2RUM3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AU015836B2RUM3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
AU015836B2RUM3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AU015836B2RUM3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AU015836B2RUM3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AU015836B2RUM3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AU015836B2RUM3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
AU015836B2RUM3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AU015836B2RUM3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AU015836B2RUM3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AU015836B2RUM3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
AU015836B2RUM3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AU015836B2RUM3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AU015836B2RUM3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AU015836B2RUM3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AU015836B2RUM3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AU015836B2RUM3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AU015836B2RUM3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AU015836B2RUM3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AU015836B2RUM3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AU015836B2RUM3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AU015836B2RUM3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AU015836B2RUM3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AU015836B2RUM3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AU015836B2RUM3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AU015836B2RUM3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AU015836B2RUM3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AU015836B2RUM3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AU015836B2RUM3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AU015836B2RUM3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AU015836B2RUM3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AU015836B2RUM3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AU015836B2RUM3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AU015836B2RUM3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AU015836B2RUM3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AU015836B2RUM3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AU015836B2RUM3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AU015836B2RUM3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AU015836B2RUM3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AU015836B2RUM3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AU015836B2RUM3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AU015836B2RUM3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AU015836B2RUM3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AU015836B2RUM3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AU015836B2RUM3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AU015836B2RUM3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AU015836B2RUM3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AU015836B2RUM3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AU015836B2RUM3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AU015836B2RUM3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AU015836B2RUM3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AU015836B2RUM3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AU015836B2RUM3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AU015836B2RUM3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.7 ms