Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fam71e1A1L3C1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fam71e1A1L3C1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Fam71e1A1L3C1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Fam71e1A1L3C1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Fam71e1A1L3C1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Fam71e1A1L3C1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Fam71e1A1L3C1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Fam71e1A1L3C1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Fam71e1A1L3C1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Fam71e1A1L3C1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Fam71e1A1L3C1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Fam71e1A1L3C1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Fam71e1A1L3C1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Fam71e1A1L3C1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Fam71e1A1L3C1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Fam71e1A1L3C1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Fam71e1A1L3C1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Fam71e1A1L3C1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Fam71e1A1L3C1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fam71e1A1L3C1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fam71e1A1L3C1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Fam71e1A1L3C1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fam71e1A1L3C1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Fam71e1A1L3C1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Fam71e1A1L3C1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Fam71e1A1L3C1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Fam71e1A1L3C1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Fam71e1A1L3C1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Fam71e1A1L3C1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Fam71e1A1L3C1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Fam71e1A1L3C1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Fam71e1A1L3C1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Fam71e1A1L3C1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Fam71e1A1L3C1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fam71e1A1L3C1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fam71e1A1L3C1 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Fam71e1A1L3C1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fam71e1A1L3C1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fam71e1A1L3C1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Fam71e1A1L3C1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fam71e1A1L3C1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fam71e1A1L3C1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fam71e1A1L3C1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fam71e1A1L3C1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fam71e1A1L3C1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Fam71e1A1L3C1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fam71e1A1L3C1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fam71e1A1L3C1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fam71e1A1L3C1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fam71e1A1L3C1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fam71e1A1L3C1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Fam71e1A1L3C1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Fam71e1A1L3C1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Fam71e1A1L3C1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Fam71e1A1L3C1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Fam71e1A1L3C1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fam71e1A1L3C1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fam71e1A1L3C1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Fam71e1A1L3C1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fam71e1A1L3C1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fam71e1A1L3C1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fam71e1A1L3C1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fam71e1A1L3C1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fam71e1A1L3C1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fam71e1A1L3C1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fam71e1A1L3C1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fam71e1A1L3C1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fam71e1A1L3C1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fam71e1A1L3C1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fam71e1A1L3C1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fam71e1A1L3C1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fam71e1A1L3C1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fam71e1A1L3C1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fam71e1A1L3C1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fam71e1A1L3C1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fam71e1A1L3C1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fam71e1A1L3C1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Fam71e1A1L3C1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fam71e1A1L3C1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fam71e1A1L3C1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fam71e1A1L3C1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fam71e1A1L3C1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fam71e1A1L3C1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fam71e1A1L3C1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fam71e1A1L3C1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fam71e1A1L3C1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fam71e1A1L3C1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fam71e1A1L3C1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fam71e1A1L3C1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fam71e1A1L3C1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fam71e1A1L3C1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fam71e1A1L3C1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fam71e1A1L3C1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fam71e1A1L3C1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fam71e1A1L3C1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fam71e1A1L3C1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fam71e1A1L3C1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fam71e1A1L3C1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fam71e1A1L3C1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.4 ms