Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1W9

Stk39, STE20/SPS1-related proline-alanine-rich protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk39Q9Z1W9 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stk39Q9Z1W9 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stk39Q9Z1W9 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stk39Q9Z1W9 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stk39Q9Z1W9 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stk39Q9Z1W9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stk39Q9Z1W9 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stk39Q9Z1W9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stk39Q9Z1W9 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stk39Q9Z1W9 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stk39Q9Z1W9 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stk39Q9Z1W9 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stk39Q9Z1W9 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stk39Q9Z1W9 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stk39Q9Z1W9 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stk39Q9Z1W9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stk39Q9Z1W9 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stk39Q9Z1W9 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stk39Q9Z1W9 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stk39Q9Z1W9 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stk39Q9Z1W9 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Stk39Q9Z1W9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stk39Q9Z1W9 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stk39Q9Z1W9 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stk39Q9Z1W9 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stk39Q9Z1W9 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stk39Q9Z1W9 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stk39Q9Z1W9 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Stk39Q9Z1W9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stk39Q9Z1W9 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stk39Q9Z1W9 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stk39Q9Z1W9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stk39Q9Z1W9 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stk39Q9Z1W9 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Stk39Q9Z1W9 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms