Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Mrpl28Q9D1B9 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Mrpl28Q9D1B9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Mrpl28Q9D1B9 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Mrpl28Q9D1B9 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Mrpl28Q9D1B9 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Mrpl28Q9D1B9 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Mrpl28Q9D1B9 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Mrpl28Q9D1B9 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Mrpl28Q9D1B9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Mrpl28Q9D1B9 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Mrpl28Q9D1B9 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Mrpl28Q9D1B9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mrpl28Q9D1B9 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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