Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms