Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHP6

Phc3, Polyhomeotic-like protein 3, mousemouse

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc3Q8CHP6 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phc3Q8CHP6 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms