Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms