Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GTF2H2Q13888 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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