Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEUROD1Q13562 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
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