Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RPS3AP61247 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms