Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ldb2O55203 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ldb2O55203 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ldb2O55203 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ldb2O55203 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ldb2O55203 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ldb2O55203 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ldb2O55203 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ldb2O55203 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ldb2O55203 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ldb2O55203 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ldb2O55203 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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