Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BRPF3Q9ULD4 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms