Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRP2BPQ9P2M1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms