Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms