Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ERVK-5Q9HDB9 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms