Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CHCHD4Q8N4Q1 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms