Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPOCD1Q6ZMY3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPOCD1Q6ZMY3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms