Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCN3

Ttbk1, Tau-tubulin kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttbk1Q6PCN3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttbk1Q6PCN3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttbk1Q6PCN3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttbk1Q6PCN3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttbk1Q6PCN3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttbk1Q6PCN3 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttbk1Q6PCN3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttbk1Q6PCN3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttbk1Q6PCN3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttbk1Q6PCN3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttbk1Q6PCN3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttbk1Q6PCN3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttbk1Q6PCN3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttbk1Q6PCN3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttbk1Q6PCN3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttbk1Q6PCN3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttbk1Q6PCN3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttbk1Q6PCN3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttbk1Q6PCN3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttbk1Q6PCN3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttbk1Q6PCN3 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttbk1Q6PCN3 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttbk1Q6PCN3 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttbk1Q6PCN3 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttbk1Q6PCN3 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttbk1Q6PCN3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttbk1Q6PCN3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttbk1Q6PCN3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttbk1Q6PCN3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttbk1Q6PCN3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttbk1Q6PCN3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttbk1Q6PCN3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttbk1Q6PCN3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttbk1Q6PCN3 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttbk1Q6PCN3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttbk1Q6PCN3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttbk1Q6PCN3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttbk1Q6PCN3 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttbk1Q6PCN3 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttbk1Q6PCN3 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttbk1Q6PCN3 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttbk1Q6PCN3 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttbk1Q6PCN3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttbk1Q6PCN3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttbk1Q6PCN3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttbk1Q6PCN3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttbk1Q6PCN3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttbk1Q6PCN3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttbk1Q6PCN3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttbk1Q6PCN3 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttbk1Q6PCN3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttbk1Q6PCN3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttbk1Q6PCN3 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttbk1Q6PCN3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttbk1Q6PCN3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttbk1Q6PCN3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttbk1Q6PCN3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttbk1Q6PCN3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttbk1Q6PCN3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttbk1Q6PCN3 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttbk1Q6PCN3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttbk1Q6PCN3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttbk1Q6PCN3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttbk1Q6PCN3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttbk1Q6PCN3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttbk1Q6PCN3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttbk1Q6PCN3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttbk1Q6PCN3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttbk1Q6PCN3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttbk1Q6PCN3 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttbk1Q6PCN3 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttbk1Q6PCN3 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttbk1Q6PCN3 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttbk1Q6PCN3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttbk1Q6PCN3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttbk1Q6PCN3 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttbk1Q6PCN3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttbk1Q6PCN3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttbk1Q6PCN3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttbk1Q6PCN3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttbk1Q6PCN3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttbk1Q6PCN3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttbk1Q6PCN3 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttbk1Q6PCN3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttbk1Q6PCN3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttbk1Q6PCN3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttbk1Q6PCN3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttbk1Q6PCN3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttbk1Q6PCN3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttbk1Q6PCN3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttbk1Q6PCN3 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttbk1Q6PCN3 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttbk1Q6PCN3 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttbk1Q6PCN3 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttbk1Q6PCN3 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttbk1Q6PCN3 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttbk1Q6PCN3 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttbk1Q6PCN3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttbk1Q6PCN3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttbk1Q6PCN3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
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