Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ItgaeQ60677 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ItgaeQ60677 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ItgaeQ60677 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ItgaeQ60677 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ItgaeQ60677 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ItgaeQ60677 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ItgaeQ60677 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms