Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACSM3Q53FZ2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms