Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

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Length 840 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx25Q3ZT31 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx25Q3ZT31 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx25Q3ZT31 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx25Q3ZT31 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx25Q3ZT31 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx25Q3ZT31 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx25Q3ZT31 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx25Q3ZT31 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx25Q3ZT31 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx25Q3ZT31 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx25Q3ZT31 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx25Q3ZT31 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx25Q3ZT31 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx25Q3ZT31 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx25Q3ZT31 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx25Q3ZT31 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx25Q3ZT31 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Snx25Q3ZT31 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx25Q3ZT31 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Snx25Q3ZT31 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx25Q3ZT31 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Snx25Q3ZT31 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Snx25Q3ZT31 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Snx25Q3ZT31 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Snx25Q3ZT31 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Snx25Q3ZT31 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Snx25Q3ZT31 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Snx25Q3ZT31 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Snx25Q3ZT31 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Snx25Q3ZT31 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Snx25Q3ZT31 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx25Q3ZT31 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms