Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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AP3B2Q13367 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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AP3B2Q13367 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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AP3B2Q13367 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
AP3B2Q13367 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
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