Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Cnn1Q08091 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Cnn1Q08091 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Cnn1Q08091 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Cnn1Q08091 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Cnn1Q08091 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Cnn1Q08091 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnn1Q08091 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms