Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTBN1Q01082 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms