Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcdP82347 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcdP82347 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SgcdP82347 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgcdP82347 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SgcdP82347 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms